纳米孔测序系列讲座丨香港大学张彤教授：使用纳米孔测序检测污水中抗生素抗性基因

目前，细菌的耐药性作为一个公共健康的严重威胁，受到越来越多的关注。这不仅是一个医学和公共健康的问题，同时也是新兴的环境污染问题，但是我们对它的认识还十分有限。

香港大学张彤教授研究团队通过生物信息学的手段，整理已报道的抗性基因的数据库，并针对二代测序结果开发了ARGs-OAP耐药基因的检测分析平台，实现了细胞水平抗性基因的定量分析。结合Oxford Nanopore三代测序技术，进一步促进了对抗性基因的快速鉴定和宿主追踪，极大促进了对耐药菌株基因组的重构，为揭示耐药基因的传播机制提供了重要技术支持。

早在2014年，MinION测序仪还在早期试用计划时，张彤教授所带领的实验室就最早开始使用纳米孔测序了，是最早的一批用户之一，有着丰富的使用经验。在最新一期的系列讲座中，张彤教授将为我们带来《使用纳米孔测序检测污水中抗生素抗性基因》。

 讲 师 简 介 

张彤 香港大学教授

张彤教授是香港大学土木工程系教授，香港大学公共卫生学院荣誉教授，主要研究方向为环境生物信息学、微生物组学技术、污水生物处理、新兴污染物的生物降解、抗生素抗性基因检测等。在The ISME Journal、Environmental Science & Technology、Water Research、Bioinformatics等学术期刊上发表论文200多篇，获得中国和美国专利各一项。2011—2014年间受聘兼任“华大基因”环境微生物和环境生物技术的特邀顾问，2013-2016年受聘兼任南京大学讲座教授，2015年获得中国教育部自然科学一等奖，2016年国家自然科学二等奖，2017年香港大学优秀研究生导师，并入选2018年度全球“高被引科学家”。

本期课程探基学院特邀张彤教授为我们带来《使用纳米孔测序检测污水中抗生素抗性基因》。张教授将介绍其使用纳米孔测序的经验和取得的成果：

1. MinION测序仪的发展和应用；

2.快速分析污水处理厂中的抗性细菌；

3. 遗传元件的分析以及宿主追踪；

4.一张测序芯片12个基因组组装。

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注：Nanopore技术目前仅供研究使用。

讲座内容含未发表的研究数据，未经允许，请勿擅自使用。

原文：测序中国

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